Zielnik przechowuje się układając karty w taki sposób, aby rośliny nie ulegały uszkodzeniu a karty nie deformowały się. Przy długowiecznym z założenie zielniku, w razie pojawienia się szkodników, stosuje się kilkakrotne zamrażanie i rozmrażanie w zamrażarce. Wówczas należy karty zapakować szczelnie w folię, aby osadzający się szron nie zniszczył egzemplarzy. Kiedyś do dezynsekcji stosowało się środki chemiczne i naftalinę do odstraszania owadów.